ALP染色的原理基于ALP能够水解磷酸基团，释放出无机磷酸盐，并产生能够与底物反应的颜色产物。在染色过程中，使用特定的底物如二氯酚磷酸盐（BCIP）或其他可溶性磷酸底物，底物水解后形成不溶的彩色产物，常见的染色结果为蓝色或紫色，能够显示出ALP活性区域。
ALP染色常用于以下研究领域：
骨生物学：通过检测ALP活性评估骨形成过程，特别是在破骨细胞和成骨细胞的研究中。
肝脏疾病：ALP的水平在某些肝脏疾病（如肝胆病变）中可能升高，因此ALP染色有助于肝脏相关病变的检测。
癌症研究：一些肿瘤（如骨癌和乳腺癌等）可能表现出不同的ALP活性，ALP染色有助于这些肿瘤的研究。
ALP染色对样本的处理有一定要求。一般来说，样本应在固定后尽量避免脱水或解离。常用的固定液是4% PFA（多聚甲醛）。切片应为厚度为5-10μm的薄片，确保组织结构完整。
